Die Zwiebel und die Knoblauchzehen schälen und in kleine Würfel schneiden. Einen Topf mit Olivenöl erhitzen und die Zwiebeln und Knoblauchzehen darin glasig anschwitzen. Mit Rotwein und dunklem Balsamico ablöschen und kurz einkochen lassen. Eine Dose gehackte Tomaten hinzugeben, sowie die Kräuter Oregano und Thymian. Geschroteter Pfeffer, Salz, Chiliflocken und eine Prise Zucker hineinrühren.
250 ml Wasser hinzugeben und 5 Minuten ohne Deckel einköcheln lassen. Beim anschließenden Abschmecken vorsichtig mit dem Salz umgehen, da die Muscheln "von Natur aus" noch eine salzige Note mitbringen.
Das Tomatensugo ist nun bereit für die Muscheln. Hineingeben, umrühren und bei geschlossenem Deckel ca. 15 Minuten köcheln lassen.